菌類の生育は高度や植生などによって異なるが，本県で最も一般的な常緑広葉樹林では，普通6月～9月に多く観察される。ブナ林では秋季～初冬にかけて，海岸マツ林では5月～9月と冬季，と時期が異なる。希少な菌類は樹木相の変化により，やはりブナ林，マツ林で多くなっている。もともと希少なものには温・寒帯性のもの，亜熱帯性のものがある。きのこ類の中では食用として利用されるもの，樹木病害性のものが注目されて情報が多いが，これらは工場緑地や公共施設緑地，公園などで見られることが多い。