「甲殻類その他」では，減少要因がはっきりしない種も少なくないが，福岡県RDB2014では，「河川開発」，「海岸開発」，「水質汚濁」，「産地局限」の4つが，「危機要因」として選ばれることが多かった。中でも，「河川開発」，「海岸開発」は，ハビタットの悪化だけでなく，消失をもたらすことが少なくない。また，ハビタットの分断・孤立化などによる「産地局限」は，繁殖個体の交流が難しくなるだけでなく，プランクトン幼生期を持つ種では，放出した幼生の大部分が無効分散になるなどの悪影響をもたらす（地域個体群ネットワークの崩壊）。以下，ハビタット毎に危機の要因を簡単に解説する。

• (1)砂質干潟

  砂質干潟は，ウミサボテン，ニッポンオフェリア，テナガツノヤドカリ，ナメクジウオなどの生息地であり，堅い砂泥質の干潟とともに，生息環境の悪化が著しい場所である。原因は，底質の悪化（泥化や汚染）であると考えられる。泥化の原因は，ダム・砂防ダムの建設，河川や海域での砂利・砂の採取などである。一方，汚染の原因としては，生活排水や汚染物質の流入などが考えられる。

• (2)軟泥干潟

  軟泥干潟は，アリアケカワゴカイ，アリアケヤワラガニ，ヒメムツアシガニ，ヒメヤマトオサガニなどの生息地として重要である。軟泥干潟は，潮流の弱い場所に形成されるため，底質の汚染などにより，貧酸素水塊や硫化物の影響を受けやすい環境である。また，特に海岸部の泥質干潟は，干拓や埋立によって消失する危険性が大きい。

• (3)河川感潮域

  河川干潟と潮下帯は，イトメ，アリアケモドキ，カワスナガニなどの生息地として重要である。しかし，これらの場所では，水質・底質の悪化によって環境が悪化している場所が少なくない。また，河川改修や河川浚渫なども，このような場所に生息する種にとって，生存の脅威となっている。

• (4)塩性湿地

  塩性湿地（周辺の裸地・転石地を含む）は，ウモレベンケイガニ，クシテガニ，アリアケガニ，シオマネキなどの生息地として重要であるが，その多くが，河川改修や河川浚渫などによって悪化・消失している。また，最近では，塩性湿地に浚渫土砂が捨てられることも多く，それが生息地破壊の直接の原因になっている。

• この他，生息地ではないが，宿主特異性の高い種（寄生・共生種）にとって，宿主の減少は，生存に大きく影響する。カブトガニウズムシ（宿主は，カブトガニ），ウチノミヤドリカニダマシとオオヨコナガピンノ（宿主は，両種ともツバサゴカイ）などでは，宿主の減少が，生存に対する直接の脅威になっている。一方，マキガイイソギンチャク（宿主は，アラムシロ），アリアケヤワラガニとヒメムツアシガニ（宿主は，両種ともトゲイカリナマコ）のように，宿主は減少していないが，寄生共生種が減少している場合もある。