本州以南に生息していた種はオオカミの亜種C. l. hodophilaxとする立場と，独立種ニホンオオカミとする立場がある。一般には，1905年奈良県での捕獲が最後で絶滅したとされる。筑前国続風土記（1709）に「国内処々に多し」とされ，筑前国産物帳（1736）にも記載があり，1700年代には広く分布していたと考えられる。

平尾台の「こむそう穴」と「人参窪第一洞」でニホンオオカミとされる頭蓋と下顎の一部が発見されているものの，時代ははっきりしない。県内の絶滅がいつの時代であったかは定かではない。