伊藤・松本（2013）によれば，柳川市・大牟田市の水深 ＋1 m以浅では，本種がマガキ・スミノエガキよりも卓越しており，筑後川・沖端川河口内の調査地点では100 %がシカメガキで占められていた。すなわち，県内有明海沿岸では極めて多産する優占種であり，特に減少傾向は認められない。しかしながら，国内分布が有明海・八代海北部に限定されるため，準絶滅危惧に評価した。佐賀県鹿島市などでは，ナルトビエイによる食害が顕著である。

有明海，八代海，朝鮮半島，中国大陸沿岸に分布。