複数の生息地が確認されているが，全ての生息地において，生息環境悪化のリスクが大きい。

周防灘，玄界灘の河口域および前浜干潟，有明海の前浜干潟

体長4.5 cm。体側の斑紋が不明瞭である，尾鰭下部に斑紋がない，下顎下面に髭がないなどの特徴で近似のチクゼンハゼと区別できる。大規模河川の河口干潟，もしくは規模の大きな湾の前浜干潟に生息する。干潮時にタイドプールが形成されるような潮間帯傾斜の緩い干潟に生息しており，生息地の地盤高は平均潮位と大潮干潮位の間であることが多い。生息地の底質は，砂や砂泥であり，近縁種のチクゼンハゼとは重複するものの，本種のほうがやや粒径が小さい環境に生息していることが多い。福岡県博多湾においては，1月から4月にかけて，主にニホンスナモグリと思われる生息孔で産卵が確認されている。