九州北部地域は回遊型の生活史を有するニホンイトヨの分布南限地域であるが，河口堰等により遡上が阻害されている河川が多い。また，下流域において本種の営巣に適した環境もほとんど失われている。2001年版評価時から合わせて30年以上にわたり県内での確認例はなく，絶滅した可能性も高い。

加茂川，室見川，遠賀川の各水系，博多湾，津屋崎干潟

3月頃河川を遡上し，下流域の植物の豊富な場所に巣をつくり繁殖を行う。孵化後，降海し海域で成長する。本種には形態的・遺伝的に区別される複数集団が知られるが，本県で確認されているものは鱗板の特徴などからすべてニホンイトヨと同定される。

近傍地では山口県長門市周辺で近年も少数ながら採集例がある。