県内の主要な山地で確認され，低地から高地まで生息しているが，その生息域は山林にほぼ限定される。確認地点も少ない。今後，自然林などの消失によって，生息数が減少する可能性がある。また，山麓域は開発の対象になりやすく，低地における生息域の減少がさらに進むことが考えられる。

日本固有種である。本州中部以北のものを乳頭数の違いなどから別種のカゲネズミＥ.kageusとする意見もあったが，交配実験や核型などから両者は同一種であると結論されている。地下のトンネル生活に適応して，耳介や眼が小さく，尾は短い。背面の毛は赤みを帯びた褐色，腹面の毛は淡黄褐色である。体重25～35g ，頭胴長100～115mm，尾長40～45mm，後足長17～19mm，耳長11～12mm，尾率は50％に達しない。ハタネズミに似るが，毛色が異なり，一般には本種がより小型で尾率は大きい。

本州の新潟，福島以南，九州，四国，隠岐島後

山林に生息し，自然林に多い。山麓に接した農耕地で見られることもある。植食性，岩などがあり，湿潤で下草の多い所を好む。低山地での繁殖活動は秋から春にかけて見られる。時にはヒノキなどの人工造林木を食害することがある。